После обновления панели управления Modx Evolution до версии 1.2.1, письма начали приходить в таком виде: ÐаÑвка на пÑодÑÐºÑ Ñ ÑайÑа. Онлайн декодер показал, что это ISO-8859-1, а в нём UTF-8.
Заходим в manager/includes/controls/phpmailer/class.phpmailer.php
Меняем
public $CharSet = 'ISO-8859-1';
на
public $CharSet = 'UTF-8';